农村水利工程基础设施建设的高峰期在上世纪50-70年代，主要依靠乡村筹资、农民投劳，以建设“千斤田、双纲田、吨粮田”为目标，实施“山水田林路、农林牧副渔”综合治理。在当时的生产方式和耕作条件下，基本实现了旱涝保收。2001年农村全面推行税费改革后，农村水利投入主体、管理体制、农业耕作方式和组织方式等均发生了根本变化，我市以服务新农村建设为中心，围绕粮食生产安全、农村饮水安全和生态环境安全，推进农村水利基础设施的建设。“十一五”期间全市农村水利建设完成直接投资达13亿元，一大批高标准的农村水利基础设施建成并投入运用，水利基础保障能力得到显著提升。
农村水利基础设施建设存在的问题主要是：
1、农村水利基础设施欠账多、不适应现阶段农业生产和新农村建设要求。一是小型泵站老化。据2009年底的统计数据，全市7924座农村小型泵站中，运行良好的占23.7%，带病运行的占74.7%；完全报废的占1.6%。二是圩堤不达标。仅宝应县运东地区72个圩口就有276公里圩堤达不到挡御射阳湖
2、政策落实到位率低、建设资金匮乏。农村水利基础设施建设属于公益性项目，从中央到地方各级政府都有资金筹措、使用及管理的政策规定。10多年前，中央政府即要求各地在当年可用财力中安排2-4%用于水利工程建设，今年1号文件又要求列入各级年度预算、专款专用，并规定从土地出让收益中提取10%用于农田水利建设。但调研发现，各地政府向上级争取项目比较积极，本级财政应拨付的资金普遍不落实。2010年以前，我市县级财政每年用于水利建设的资金仅占可用财力的0.3-0.5%；调研所到的县(市)，都未从土地出让收益中计提过农田水利建设资金，也没有准备落实的措施。
3、建设管理机制不健全，基层水利人才队伍和服务体系不适应需求。近年来，参与农村水利基础设施项目建设的有水利、农业、国土、环保、发改、建设、财政等多个部门，各自的规划、建设标准不一，导致工程不配套或重复建设。建成后管护措施不到位，不能保障长效良性运行。农村基层水利服务体系薄弱，乡镇水利站经费缺乏保障，基层水利管理和专业技术人员结构老化，队伍不稳定。
三、加强我市农村水利基础设施建设的建议
1、落实政策、创新机制，建立政府主导的多元化投入机制。认真贯彻落实中央、省委1号文件和财政部、水利部关于扶持农村水利基础设施建设的有关政策，学习借鉴其他地区的做法，例如云南省将土地出让收益的10%改为土地出让总收入的5%，保证政府投入的及时足额到位。创新水利投入机制，积极引导二三产业有实力的公司投资水利基础设施、水环境整治和节水减排等工程；在农业园区、高效农业集聚区，引导以企业为主投资农田水利基础设施建设。
2、统筹规划、整合资源，切实解决好“最后一公里”问题。通过农村水利基础设施建设统一规划和行动计划的修编、实施，对多部门的涉水基础设施项目进行整合，使有限的财力和资源发挥最大的效益。针对各地小型农田水利工程建设“最后一公里”和工程管理“最后一公里”不到位的问题，采取“1+